Occurrence record: d6dcb7c7-2168-4c25-81d1-af5db6059791

Occurrence of Piscirickettsia salmonis Fryer, Lannan, Giovannoni & Wood, 1992 recorded on 2017-05-30

Taxonomie

Nom scientifique de référence	Piscirickettsia salmonis Voir la fiche espèce
Nom cité	Piscirickettsia salmonis Fryer et al., 1992
Nom vernaculaire
Code du taxon (CD_NOM selon Taxref)	955796
Code du taxon (CD_REF selon Taxref)	955796
Déterminateur (organisme)
Rang taxonomique	Species
Règne	Bacteria
Classe	Gammaproteobacteria
Ordre	Thiotrichales
Famille	Piscirickettsiaceae
Genre	Piscirickettsia
Espèce	Piscirickettsia salmonis
Groupe taxonomique "simple"	Autres
Groupe taxonomique "avancé"	Autres

Sources

Identifiant SINP de la donnée	d6dcb7c7-2168-4c25-81d1-af5db6059791
Identifiant de la donnée chez le producteur	3916965670
Statut source	Ne sait pas
Statut d'observation	Présent
Observateur (organisme)

Date

Date de l'observation	30/05/2017
Précision de la date	DAY
Date de la détermination

Localisation

Latitude	42.48700
Longitude	3.16900
Précision géographique (en mètres)
Système de coordonnées	WGS84
Niveau de précision de la localisation	XY point
Type d'objet source	Géométrie
Nature de l’objet géographique
Toponyme
Commune
Commune (code INSEE)
EPCI
EPCI (code INSEE)
Département	Pyrenées-Orientales (mer territoriale)
Département (code INSEE)	ZMMMT66
Région/Territoire	Façade Méditerranée
Région/Territoire (code INSEE)	FACMED
Altitude minimale (en mètres)
Altitude maximale (en mètres)
Profondeur minimale (en mètres)	3.0
Profondeur maximale (en mètres)	3.0
Code maille 10x10km
Objet géographique (WKT)	Télécharger l'objet géographique (WKT)

Jeu de données

Libellé du jeu de données	EMOSE (2017) Inter-Comparison of Marine Plankton Metagenome Analysis Methods Voir la fiche INPN / Télécharger la fiche INPN
Identifiant SINP du jeu de données	20B968FD-B7E0-4002-9136-1CCFA8E5B9DF
Description	EMOSE (2017) Inter-Comparison of Marine Plankton Metagenome Analysis Methods Link GBIF portal : https://www.gbif.org/dataset/20b968fd-b7e0-4002-9136-1ccfa8e5b9df Project : Title : EMOSE (2017) Inter-Comparison of Marine Plankton Metagenome Analysis M... Voir plus
Objectifs	Regroupement de données
Mots-clefs
Territoire
Fournisseur	The French National Sequencing Center (Genoscope)
Producteur	The French National Sequencing Center (Genoscope)
Type de données	Occurrence de taxon
Téléchargement	Télécharger l'archive brute du jeu de données

Cadre d'acquisition

Libellé du cadre d'acquisition	EMOSE (2017) Inter-Comparison of Marine Plankton Metagenome Analysis Methods Voir la fiche INPN / Télécharger la fiche INPN
Identifiant SINP du cadre d'acquisition	92315cdb-1324-4d10-92de-8bfab810e420
Description	This study includes experiments from the following five sequencing strategies: 1) Shotgun DNA sequencing- 2) Amplicon sequencing after 18S amplification by PCR using 1391F/EukB primer set. Library were constructed according to Illumina Library protoc... Voir plus
Objectifs	Multiple ou autres
Mots-clefs
Référence bibliographique
Maître d'ouvrage
Maître d'œuvre
Financeur
Contact principal	The French National Sequencing Center (Genoscope)
Type de financement	Privé

Propriétés supplémentaires

Denombrement (min-max)
Objet dénombrement
Etat biologique
Sexe
Stade de vie
Comportement
Statut biologique
URL preuve
Référence bibliographique
Commentaire

Attributs additionnels

Afficher le nom des attributs Cacher le nom des attributs

Licence preuve numérique	LICENCE_PREUVE_NUM	CC_BY_4_0

Enrichissement de la donnée

Espèce protégée	Non
Espèce réglementée	Non
Espèce concernée par une directive européenne	Non
Espèce évaluée sur Liste rouge	Non
Espèce menacée sur Liste rouge nationale	Non
Espèce menacée sur Liste rouge régionale	Non
Espèce déterminante ZNIEFF	Non

En savoir plus sur les statuts

Statut biogéographique selon Taxref	Présent (indigène ou indéterminé)
Habitat selon Taxref	Marin

Attention: ces informations complémentaires sont calculées a posteriori sur la base des informations transmises.

Sensibilité de la donnée à la diffusion

Donnée sensible	Non
Niveau géographique de sensibilité
Niveau géographique de sensibilité (Libellé)
Date de calcul du niveau de sensibilité
Référentiel de sensibilité

En savoir plus sur la sensibilité

Validation nationale

Niveau de validité	Non réalisable
Validateur	PatriNat
Date de la validation	18/11/2023
Type de validation	Automatique
Protocole de validation	https://inpn.mnhn.fr/docs-web/docs/download/247445
Commentaire

En savoir plus sur la validation nationale

Validation régionale

Niveau de validité
Validateur
Date de la validation
Type de validation
Protocole de validation
Commentaire

Validation producteur

Niveau de validité
Validateur
Date de la validation
Procédure de validation

Group	Field Name	Original Value	Processed Value
Classification	Scientific name		Piscirickettsia salmonis
	Match type		taxonIdMatch
	Phylum id		522874
	Family id		955794
	Taxon concept ID		955796
	Order		Thiotrichales
	Taxon rank id		7000
	Species id		955796
	Genus		Piscirickettsia
	Left		175886
	Scientific name authorship		Fryer, Lannan, Giovannoni & Wood, 1992
	Taxon rank		species
	Genus id		955795
	Taxon ID	955796
	Order id		525443
	Right		175886
	Kingdom		Bacteria
	Class id		524151
	Phylum		Proteobacteria
	Classs		Gammaproteobacteria
	Species		Piscirickettsia salmonis
	Original name usage	Piscirickettsia salmonis Fryer et al., 1992
	Family		Piscirickettsiaceae
	Kingdom id		187502
Event	Year		2017
	Dataset / Survey name	[EMOSE (2017) Inter-Comparison of Marine Plankton Metagenome Analysis Methods]
	Month		5
	datePrecision		DAY
	Day		30
	Event date	2017-05-30/2017-05-30	2017-05-30
Occurrence	Occurrence status	Présent	PRESENT
	Basis of record	Ne sait pas	OCCURRENCE
	Record number	3916965670
	Collection code	20B968FD-B7E0-4002-9136-1CCFA8E5B9DF
	Occurrence ID	d6dcb7c7-2168-4c25-81d1-af5db6059791
	Institution code	SINP
	Information withheld	Non
	Data generalizations	XY point
	Dataset / Survey name	[EMOSE (2017) Inter-Comparison of Marine Plankton Metagenome Analysis Methods]
	Dataset ID	20B968FD-B7E0-4002-9136-1CCFA8E5B9DF	[20B968FD-B7E0-4002-9136-1CCFA8E5B9DF]
Attribution	Data resource		EMOSE (2017) Inter-Comparison of Marine Plankton Metagenome Analysis Methods
	Collection name		20B968FD-B7E0-4002-9136-1CCFA8E5B9DF
	License		UNSPECIFIED
	Data resource uid	dr23757	dr23757
	Institution uid		in1
	Institution name		SINP
	Collection uid		co3602
Location	Country	FRANCE
	Decimal latitude	42.48700	42.487
	Terrestrial	true	true
	Maximum depth in meters	3.0	3.0
	Decimal longitude	3.16900	3.169
	Biome		TERRESTRIAL
	Marine	false	false
	Minimum depth in meters	3.0	3.0
	Country code	FR
	Footprint well known text	POINT(3.169 42.487)
	Geodetic datum	WGS84	EPSG:4326