Occurrence record: 2158a175-54ce-41d9-a61b-fccfdd56eff3

Occurrence of Pectobacterium parmentieri Khayi, Cigna, Chong, Quetu-Laurent, Chan, Helias & Faure, 2016 recorded on 2008-01-01

Taxonomie

Nom scientifique de référence	Pectobacterium parmentieri Voir la fiche espèce
Nom cité	Pectobacterium parmentieri Khayi et al., 2016
Nom vernaculaire
Code du taxon (CD_NOM selon Taxref)	977481
Code du taxon (CD_REF selon Taxref)	977481
Déterminateur (organisme)
Rang taxonomique	Species
Règne	Bacteria
Classe	Gammaproteobacteria
Ordre	Enterobacteriales
Famille	Enterobacteriaceae
Genre	Pectobacterium
Espèce	Pectobacterium parmentieri
Groupe taxonomique "simple"	Autres
Groupe taxonomique "avancé"	Autres

Sources

Identifiant SINP de la donnée	2158a175-54ce-41d9-a61b-fccfdd56eff3
Identifiant de la donnée chez le producteur	3410535639
Statut source	Ne sait pas
Statut d'observation	Présent
Observateur (organisme)

Date

Date de l'observation	01/01/2008
Précision de la date	DAY
Date de la détermination

Localisation

Latitude	48.07000
Longitude	-1.41000
Précision géographique (en mètres)
Système de coordonnées	WGS84
Niveau de précision de la localisation	XY point
Type d'objet source	Géométrie
Nature de l’objet géographique
Toponyme
Commune	Domagné
Commune (code INSEE)	35096
EPCI	CA Vitré Communauté
EPCI (code INSEE)	200039022
Département	Ille-et-Vilaine
Département (code INSEE)	35
Région/Territoire	Bretagne
Région/Territoire (code INSEE)	53
Altitude minimale (en mètres)
Altitude maximale (en mètres)
Profondeur minimale (en mètres)
Profondeur maximale (en mètres)
Code maille 10x10km
Objet géographique (WKT)	Télécharger l'objet géographique (WKT)

Jeu de données

Libellé du jeu de données	Bacterial 16S Ribosomal RNA RefSeq Targeted Loci Project Voir la fiche INPN / Télécharger la fiche INPN
Identifiant SINP du jeu de données	0b0dc293-3b26-49db-b9f1-817b31ebf603
Description	The small subunit ribosomal RNA is a useful phylogenetic marker that has been used extensively for evolutionary analyses. The RefSeq dataset contains curated 16S ribosomal RNA sequences that correspond to bacteria type materials. The RefSeq records m... Voir plus
Objectifs	Regroupement de données
Mots-clefs
Territoire
Fournisseur	National Center for Biotechnology Information-PATRINAT (OFB-MNHN-CNRS-IRD)
Producteur
Type de données	Occurrence de taxon
Téléchargement	Télécharger l'archive brute du jeu de données

Cadre d'acquisition

Libellé du cadre d'acquisition	Bacterial 16S Ribosomal RNA RefSeq Targeted Loci Project Voir la fiche INPN / Télécharger la fiche INPN
Identifiant SINP du cadre d'acquisition	252779c5-08a8-4801-92cf-4fa61befd048
Description	The small subunit ribosomal RNA is a useful phylogenetic marker that has been used extensively for evolutionary analyses. The RefSeq dataset contains curated 16S ribosomal RNA sequences that correspond to bacteria type materials. The RefSeq records m... Voir plus
Objectifs	Multiple ou autres
Mots-clefs
Référence bibliographique
Maître d'ouvrage
Maître d'œuvre
Financeur
Contact principal	National Center for Biotechnology Information
Type de financement	Privé

Propriétés supplémentaires

Denombrement (min-max)
Objet dénombrement
Etat biologique
Sexe
Stade de vie
Comportement
Statut biologique
URL preuve	NR_153752
Référence bibliographique
Commentaire	Pectobacterium parmentieri strain RNS 08-42-1A 16S ribosomal RNA, complete sequence

Attributs additionnels

Afficher le nom des attributs Cacher le nom des attributs

Licence preuve numérique	LICENCE_PREUVE_NUM	CC_BY_4_0

Enrichissement de la donnée

Espèce protégée	Non
Espèce réglementée	Non
Espèce concernée par une directive européenne	Non
Espèce évaluée sur Liste rouge	Non
Espèce menacée sur Liste rouge nationale	Non
Espèce menacée sur Liste rouge régionale	Non
Espèce déterminante ZNIEFF	Non

En savoir plus sur les statuts

Statut biogéographique selon Taxref	Présent (indigène ou indéterminé)
Habitat selon Taxref	Terrestre

Attention: ces informations complémentaires sont calculées a posteriori sur la base des informations transmises.

Sensibilité de la donnée à la diffusion

Donnée sensible	Non
Niveau géographique de sensibilité
Niveau géographique de sensibilité (Libellé)
Date de calcul du niveau de sensibilité
Référentiel de sensibilité

En savoir plus sur la sensibilité

Validation nationale

Niveau de validité	Non réalisable
Validateur	PatriNat
Date de la validation	01/03/2023
Type de validation	Automatique
Protocole de validation	https://inpn.mnhn.fr/docs-web/docs/download/247445
Commentaire

En savoir plus sur la validation nationale

Validation régionale

Niveau de validité
Validateur
Date de la validation
Type de validation
Protocole de validation
Commentaire

Validation producteur

Niveau de validité
Validateur
Date de la validation
Procédure de validation

Group	Field Name	Original Value	Processed Value
Classification	Scientific name		Pectobacterium parmentieri
	Match type		taxonIdMatch
	Phylum id		522874
	Family id		626024
	Taxon concept ID		977481
	Order		Enterobacteriales
	Taxon rank id		7000
	Species id		977481
	Taxonomic issues	[FIRST_OF_MONTH, FIRST_OF_YEAR]
	Genus		Pectobacterium
	Left		175552
	Scientific name authorship		Khayi, Cigna, Chong, Quetu-Laurent, Chan, Helias & Faure, 2016
	Taxon rank		species
	Genus id		936951
	Taxon ID	977481
	Order id		626023
	Right		175552
	Kingdom		Bacteria
	Class id		524151
	Phylum		Proteobacteria
	Classs		Gammaproteobacteria
	Species		Pectobacterium parmentieri
	Original name usage	Pectobacterium parmentieri Khayi et al., 2016
	Family		Enterobacteriaceae
	Kingdom id		187502
Event	Year		2008
	Dataset / Survey name	[Bacterial 16S Ribosomal RNA RefSeq Targeted Loci Project]
	Month		1
	datePrecision		DAY
	Day		1
	Event date	2008-01-01/2008-01-01	2008-01-01
Occurrence	Occurrence status	Présent	PRESENT
	Basis of record	Ne sait pas	OCCURRENCE
	Record number	3410535639
	Collection code	0b0dc293-3b26-49db-b9f1-817b31ebf603
	Occurrence ID	2158a175-54ce-41d9-a61b-fccfdd56eff3
	Institution code	SINP
	Information withheld	Non
	Data generalizations	XY point
	Dataset / Survey name	[Bacterial 16S Ribosomal RNA RefSeq Targeted Loci Project]
	Dataset ID	0b0dc293-3b26-49db-b9f1-817b31ebf603	[0b0dc293-3b26-49db-b9f1-817b31ebf603]
	Occurrence remarks	Pectobacterium parmentieri strain RNS 08-42-1A 16S ribosomal RNA, complete sequence
Attribution	Data resource		Lot de JDD avec moins de 1000 occurences
	License		other
	Data resource uid	dr0	dr0
Location	Country	FRANCE
	Decimal latitude	48.07000	48.07
	Terrestrial	true	true
	Decimal longitude	-1.41000	-1.41
	State province		Bretagne
	Biome		TERRESTRIAL
	Marine	false	false
	Country code	FR
	Footprint well known text	POINT(-1.41 48.07)
	Geodetic datum	WGS84	EPSG:4326