Occurrence record: 8020bdd1-d589-4314-b384-f44cd60a8376

Occurrence of Sphingorhabdus pacifica Romanenko, Tanaka, Svetashev & Mikhailov, 2015 recorded on 2010-05-11

Taxonomie

Nom scientifique de référence	Sphingorhabdus pacifica Voir la fiche espèce
Nom cité	Sphingorhabdus pacifica Romanenko et al., 2015
Nom vernaculaire
Code du taxon (CD_NOM selon Taxref)	956590
Code du taxon (CD_REF selon Taxref)	956590
Déterminateur (organisme)
Rang taxonomique	Species
Règne	Bacteria
Classe	Alphaproteobacteria
Ordre	Sphingomonadales
Famille	Sphingomonadaceae
Genre	Sphingorhabdus
Espèce	Sphingorhabdus pacifica
Groupe taxonomique "simple"	Autres
Groupe taxonomique "avancé"	Autres

Sources

Identifiant SINP de la donnée	8020bdd1-d589-4314-b384-f44cd60a8376
Identifiant de la donnée chez le producteur	2017717945
Statut source	Ne sait pas
Statut d'observation	Présent
Observateur (organisme)

Date

Date de l'observation	11/05/2010
Précision de la date	DAY
Date de la détermination

Localisation

Latitude	-21.45930
Longitude	54.30410
Précision géographique (en mètres)
Système de coordonnées	WGS84
Niveau de précision de la localisation	XY point
Type d'objet source	Géométrie
Nature de l’objet géographique
Toponyme
Commune
Commune (code INSEE)
EPCI
EPCI (code INSEE)
Département	Réunion (domaine oceanique)
Département (code INSEE)	ZMREUDO
Région/Territoire	La Réunion
Région/Territoire (code INSEE)	TER974
Altitude minimale (en mètres)
Altitude maximale (en mètres)
Profondeur minimale (en mètres)	5.0
Profondeur maximale (en mètres)	5.0
Code maille 10x10km
Objet géographique (WKT)	Télécharger l'objet géographique (WKT)

Jeu de données

Libellé du jeu de données	Amplicon sequencing of Tara Oceans DNA samples corresponding to size fractions for protists. Voir la fiche INPN / Télécharger la fiche INPN
Identifiant SINP du jeu de données	D596FCCB-2319-42EB-B13B-986C932780AD
Description	Seawater was filtered from different depths to retain small and large cell sizes (Protists Organisms). The DNA was extracted and amplified by PCR. Link GBIF portal : https://www.gbif.org/dataset/d596fccb-2319-42eb-b13b-986c932780ad Project : Title : ... Voir plus
Objectifs	Regroupement de données
Mots-clefs
Territoire
Fournisseur	The French National Sequencing Center (Genoscope)
Producteur	The French National Sequencing Center (Genoscope)
Type de données	Occurrence de taxon
Téléchargement	Télécharger l'archive brute du jeu de données

Cadre d'acquisition

Libellé du cadre d'acquisition	Amplicon sequencing of Tara Oceans DNA samples corresponding to size fractions for protists. Voir la fiche INPN / Télécharger la fiche INPN
Identifiant SINP du cadre d'acquisition	fc02f68c-f016-4af9-a47d-501963b8f14f
Description	Analysis of 18S DNA in Tara Oceans Protists size fractions through amplicon sequencing: Seawater was filtered from different depths to retain small and large cell sizes. The DNA was extracted and amplified by PCR.
Objectifs	Multiple ou autres
Mots-clefs
Référence bibliographique
Maître d'ouvrage
Maître d'œuvre
Financeur
Contact principal	The French National Sequencing Center (Genoscope)
Type de financement	Privé

Propriétés supplémentaires

Denombrement (min-max)
Objet dénombrement
Etat biologique
Sexe
Stade de vie
Comportement
Statut biologique
URL preuve
Référence bibliographique
Commentaire

Attributs additionnels

Afficher le nom des attributs Cacher le nom des attributs

Licence preuve numérique	LICENCE_PREUVE_NUM	CC_BY_4_0

Enrichissement de la donnée

Espèce protégée	Non
Espèce réglementée	Non
Espèce concernée par une directive européenne	Non
Espèce évaluée sur Liste rouge	Non
Espèce menacée sur Liste rouge nationale	Non
Espèce menacée sur Liste rouge régionale	Non
Espèce déterminante ZNIEFF	Non

En savoir plus sur les statuts

Statut biogéographique selon Taxref
Habitat selon Taxref	Marin

Attention: ces informations complémentaires sont calculées a posteriori sur la base des informations transmises.

Sensibilité de la donnée à la diffusion

Donnée sensible	Non
Niveau géographique de sensibilité
Niveau géographique de sensibilité (Libellé)
Date de calcul du niveau de sensibilité
Référentiel de sensibilité

En savoir plus sur la sensibilité

Validation nationale

Niveau de validité	Invalide
Validateur	PatriNat
Date de la validation	18/11/2023
Type de validation	Automatique
Protocole de validation	https://inpn.mnhn.fr/docs-web/docs/download/247445
Commentaire

En savoir plus sur la validation nationale

Validation régionale

Niveau de validité
Validateur
Date de la validation
Type de validation
Protocole de validation
Commentaire

Validation producteur

Niveau de validité
Validateur
Date de la validation
Procédure de validation

Group	Field Name	Original Value	Processed Value
Classification	Scientific name		Sphingorhabdus pacifica
	Match type		taxonIdMatch
	Phylum id		522874
	Family id		956586
	Taxon concept ID		956590
	Order		Sphingomonadales
	Taxon rank id		7000
	Species id		956590
	Genus		Sphingorhabdus
	Left		174724
	Scientific name authorship		Romanenko, Tanaka, Svetashev & Mikhailov, 2015
	Taxon rank		species
	Genus id		956587
	Taxon ID	956590
	Order id		951594
	Right		174724
	Kingdom		Bacteria
	Class id		854002
	Phylum		Proteobacteria
	Classs		Alphaproteobacteria
	Species		Sphingorhabdus pacifica
	Original name usage	Sphingorhabdus pacifica Romanenko et al., 2015
	Family		Sphingomonadaceae
	Kingdom id		187502
Event	Year		2010
	Dataset / Survey name	[Amplicon sequencing of Tara Oceans DNA samples corresponding to size fractions for protists.]
	Month		5
	datePrecision		DAY
	Day		11
	Event date	2010-05-11/2010-05-11	2010-05-11
Occurrence	Occurrence status	Présent	PRESENT
	Basis of record	Ne sait pas	OCCURRENCE
	Record number	2017717945
	Collection code	D596FCCB-2319-42EB-B13B-986C932780AD
	Occurrence ID	8020bdd1-d589-4314-b384-f44cd60a8376
	Institution code	SINP
	Information withheld	Non
	Data generalizations	XY point
	Dataset / Survey name	[Amplicon sequencing of Tara Oceans DNA samples corresponding to size fractions for protists.]
	Dataset ID	D596FCCB-2319-42EB-B13B-986C932780AD	[D596FCCB-2319-42EB-B13B-986C932780AD]
Attribution	Data resource		Amplicon sequencing of Tara Oceans DNA samples corresponding to size fractions for protists.
	Collection name		D596FCCB-2319-42EB-B13B-986C932780AD
	License		UNSPECIFIED
	Data resource uid	dr25095	dr25095
	Institution uid		in1
	Institution name		SINP
	Collection uid		co4093
Location	Country	FRANCE
	Decimal latitude	-21.45930	-21.4593
	Terrestrial	false	false
	Maximum depth in meters	5.0	5.0
	Decimal longitude	54.30410	54.3041
	Biome		MARINE
	Marine	true	true
	Minimum depth in meters	5.0	5.0
	Country code	RE
	Footprint well known text	POINT(54.3041 -21.4593)
	Geodetic datum	WGS84	EPSG:4326