Occurrence record: 9c6e4c59-ce86-4a8d-a317-3f2203c259dd

Occurrence of Anaplasma phagocytophilum (Foggie, 1949) recorded on 2016-01-01

Taxonomie

Nom scientifique de référence	Anaplasma phagocytophilum Voir la fiche espèce
Nom cité	Anaplasma phagocytophilum (Foggie, 1949) Dumler et al., 2001
Nom vernaculaire
Code du taxon (CD_NOM selon Taxref)	932408
Code du taxon (CD_REF selon Taxref)	932408
Déterminateur (organisme)
Rang taxonomique	Species
Règne	Bacteria
Classe	Alphaproteobacteria
Ordre	Rickettsiales
Famille	Anaplasmataceae
Genre	Anaplasma
Espèce	Anaplasma phagocytophilum
Groupe taxonomique "simple"	Autres
Groupe taxonomique "avancé"	Autres

Sources

Identifiant SINP de la donnée	9c6e4c59-ce86-4a8d-a317-3f2203c259dd
Identifiant de la donnée chez le producteur	3348646886
Statut source	Ne sait pas
Statut d'observation	Présent
Observateur (organisme)

Date

Date de l'observation	01/01/2016
Précision de la date	DAY
Date de la détermination

Localisation

Latitude	47.37000
Longitude	2.29000
Précision géographique (en mètres)
Système de coordonnées	WGS84
Niveau de précision de la localisation	XY point
Type d'objet source	Géométrie
Nature de l’objet géographique
Toponyme
Commune	Presly
Commune (code INSEE)	18185
EPCI	CC Sauldre et Sologne
EPCI (code INSEE)	200000933
Département	Cher
Département (code INSEE)	18
Région/Territoire	Centre-Val de Loire
Région/Territoire (code INSEE)	24
Altitude minimale (en mètres)
Altitude maximale (en mètres)
Profondeur minimale (en mètres)
Profondeur maximale (en mètres)
Code maille 10x10km
Objet géographique (WKT)	Télécharger l'objet géographique (WKT)

Jeu de données

Libellé du jeu de données	INSDC Host Organism Sequences Voir la fiche INPN / Télécharger la fiche INPN
Identifiant SINP du jeu de données	393b8c26-e4e0-4dd0-a218-93fc074ebf4e
Description	Link GBIF portal : https://www.gbif.org/dataset/393b8c26-e4e0-4dd0-a218-93fc074ebf4e
Objectifs	Regroupement de données
Mots-clefs
Territoire
Fournisseur	PATRINAT (OFB-MNHN-CNRS-IRD)
Producteur
Type de données	Occurrence de taxon
Téléchargement	Télécharger l'archive brute du jeu de données

Cadre d'acquisition

Libellé du cadre d'acquisition	INSDC Host Organism Sequences Voir la fiche INPN / Télécharger la fiche INPN
Identifiant SINP du cadre d'acquisition	3218d2d0-b886-4126-839f-6f6cd4e60234
Description	You can find the mapping used to format the EMBL data to Darwin Core Archive here: https://github.com/gbif/embl-adapter/blob/master/DATAMAPPING.md
Objectifs	Multiple ou autres
Mots-clefs
Référence bibliographique
Maître d'ouvrage
Maître d'œuvre
Financeur
Contact principal
Type de financement	Privé

Propriétés supplémentaires

Denombrement (min-max)
Objet dénombrement
Etat biologique
Sexe
Stade de vie
Comportement
Statut biologique
URL preuve
Référence bibliographique
Commentaire	Anaplasma phagocytophilum isolate BV0006 major surface protein 4 (msp4) gene, partial cds.

Attributs additionnels

Afficher le nom des attributs Cacher le nom des attributs

Licence preuve numérique	LICENCE_PREUVE_NUM	CC_BY_4_0

Enrichissement de la donnée

Espèce protégée	Non
Espèce réglementée	Non
Espèce concernée par une directive européenne	Non
Espèce évaluée sur Liste rouge	Non
Espèce menacée sur Liste rouge nationale	Non
Espèce menacée sur Liste rouge régionale	Non
Espèce déterminante ZNIEFF	Non

En savoir plus sur les statuts

Statut biogéographique selon Taxref	Présent (indigène ou indéterminé)
Habitat selon Taxref	Continental (terrestre et/ou eau douce)

Attention: ces informations complémentaires sont calculées a posteriori sur la base des informations transmises.

Sensibilité de la donnée à la diffusion

Donnée sensible	Non
Niveau géographique de sensibilité
Niveau géographique de sensibilité (Libellé)
Date de calcul du niveau de sensibilité
Référentiel de sensibilité

En savoir plus sur la sensibilité

Validation nationale

Niveau de validité	Non réalisable
Validateur	PatriNat
Date de la validation	18/11/2023
Type de validation	Automatique
Protocole de validation	https://inpn.mnhn.fr/docs-web/docs/download/247445
Commentaire

En savoir plus sur la validation nationale

Validation régionale

Niveau de validité
Validateur
Date de la validation
Type de validation
Protocole de validation
Commentaire

Validation producteur

Niveau de validité
Validateur
Date de la validation
Procédure de validation

Group	Field Name	Original Value	Processed Value
Classification	Scientific name		Anaplasma phagocytophilum
	Match type		taxonIdMatch
	Phylum id		522874
	Family id		854004
	Taxon concept ID		932408
	Order		Rickettsiales
	Taxon rank id		7000
	Species id		932408
	Taxonomic issues	[FIRST_OF_MONTH, FIRST_OF_YEAR]
	Genus		Anaplasma
	Left		174624
	Scientific name authorship		(Foggie, 1949)
	Taxon rank		species
	Genus id		854005
	Taxon ID	932408
	Order id		854003
	Right		174624
	Kingdom		Bacteria
	Class id		854002
	Phylum		Proteobacteria
	Classs		Alphaproteobacteria
	Species		Anaplasma phagocytophilum
	Original name usage	Anaplasma phagocytophilum (Foggie, 1949) Dumler et al., 2001
	Family		Anaplasmataceae
	Kingdom id		187502
Event	Year		2016
	Dataset / Survey name	[INSDC Host Organism Sequences]
	Month		1
	datePrecision		DAY
	Day		1
	Event date	2016-01-01/2016-01-01	2016-01-01
Occurrence	Occurrence status	Présent	PRESENT
	Basis of record	Ne sait pas	OCCURRENCE
	Record number	3348646886
	Collection code	393b8c26-e4e0-4dd0-a218-93fc074ebf4e
	Occurrence ID	9c6e4c59-ce86-4a8d-a317-3f2203c259dd
	Institution code	SINP
	Information withheld	Non
	Data generalizations	XY point
	Dataset / Survey name	[INSDC Host Organism Sequences]
	Dataset ID	393b8c26-e4e0-4dd0-a218-93fc074ebf4e	[393b8c26-e4e0-4dd0-a218-93fc074ebf4e]
	Occurrence remarks	Anaplasma phagocytophilum isolate BV0006 major surface protein 4 (msp4) gene, partial cds.
Attribution	Data resource		INSDC Host Organism Sequences
	Collection name		393b8c26-e4e0-4dd0-a218-93fc074ebf4e
	License		other
	Data resource uid	dr63184	dr63184
	Institution uid		in1
	Institution name		SINP
	Collection uid		co10972
Location	Country	FRANCE
	Decimal latitude	47.37000	47.37
	Terrestrial	true	true
	Decimal longitude	2.29000	2.29
	Biome		TERRESTRIAL
	Marine	false	false
	Country code	FR
	Footprint well known text	POINT(2.29 47.37)
	Geodetic datum	WGS84	EPSG:4326